名偵探柯南

名推理小說家新名任太郎的女兒來到毛利的事務所、請求他幫忙尋找自己已失蹤二個月的父母親、但他過去並未收到勒索電話、出版社也定時收到傳去的稿件這到底意味著什麼？原來一切謎題就藏在小說之中。

在服部平次和柯南對小說內容中的暗號加以推敲之後、竟然真的發現作者在小說中透漏的被監禁的地點、在大隊人馬趕到的時候、卻發現這一切都是作者新名任太郎的一個設計、為的是滿足他死前的心願、虛驚一場。

柯南與小蘭毛利一行人受服部平次之邀～來到大阪參觀、一路吃了許多大阪的名產、就在中途遇到一名死者從大樓上摔下、且已死亡一日、這件案子與之前大阪發生的前兩宗殺人案息息相關、柯南與平次便又被捲入推理的工作中就再調查到一個可能知道內情的女人時、她又遇害。

原來連續殺人案件的被害人在２０年前都是同一家集訓考照教練場的學生、他們在２０年前的教官：稻葉在畢業當天因意外死亡、他的兒子阪田祐介當了警官、誓言為父查出真相、之後便設計了這一連串的殺人計劃。

柯南與步美四人走到米花神社前面時、碰到扮成突擊警察隊的本田、又碰到扮演假面超人的堤康之、順勢接受他的邀請參加影迷俱樂部的派對、誰支卻目睹三島舉槍殺人又自殺的案件、誰知一切都是本田為了為弟弟報仇所做的殺人計劃。

毛利受邀到山崎社長計劃建立的溫泉勝地進行破土儀式的宣傳活動、卻在中午吃飯喝酒時意外發現山崎社長墜樓身亡、本疑為因黃蜂引起的意外、沒想到期中確暗藏了一件謀殺計劃、柯南當然又利用毛利進行了一場精采的推理。

柯南與毛利小蘭準備一起去聽沖野洋子的演唱會、誰知因為毛利把門票弄掉巧遇青島全代小姐、碰上她妹妹在家自殺的案件、凶案現場是個被密封成密室的浴室、但柯南卻看出端倪、識破兇手的手法、兇手到底是誰呢？

經過柯南的抽絲剝繭、找到全代小姐額頭上所戴的頭巾就是證明她行兇的最好證據之後、便指名全代小姐就是殺人真凶、並一一解開她製造浴室這個密室的手法。

柯南與步美等少年偵探隊員回到毛利偵探事務所、聽到答錄機裡的留言、主動去找打電話的淺野雅紀、竟然意外碰到亞紀被綁架的事件、利用扣機的留言解開整個綁架案。

石本社長因為接到恐嚇信、央請毛利小五郎為他調查相關案件、並抓出恐嚇者、誰知卻牽連高田議長被射殺、好不容易查出可能嫌犯：平岡志郎、他卻在翌日被人發現陳屍藏身的廢棄大樓、兇手到底是誰？柯南能夠抽絲剝繭找出來嗎？

原來高田議員之所以會死、並非因為石本先生受人恐嚇而被央及無辜、主要是因為他的秘書新倉先生在外一向被稱為是高田的後記者、但高田卻始終不肯退位、便與平岡連手設計了這一整套殺人計劃。

小蘭和園子班上有個轉學生、還是一個旅行劇團的團長、園子等人為了能到劇院後台參觀、表示願意幫忙發傳單、但在參觀後、柯南發現劇團的人事間似乎有點問題、果不其然、編劇人在大家排系時被發現陳屍在房中、兇手到底是誰呢？

繼近石先生被殺後、劇團經理系江也掉入“奈落”裡摔死了、團長玉之助也被打傷腦部、本來玉之助嫌疑最重、好在柯南警覺請目暮警官至醫院保護他才免於兇手毒手、最後終於順利將案子解決。

柯南與叔叔到銀行去、卻剛好碰到搶奪運鈔車的意外、最後搶犯竟然一起被殺、警方將茅頭指向銀行行員廣田雅美、柯南卻注意到幕後另有黑手、原來與黑暗組織有關、這件案子到底有什麼其他發展呢？

柯南的班上來了一個轉學生、灰原哀的態度非常冷漠、卻似乎對柯南極感興趣、於是隨著步美一行人展開少年偵探隊的調查、為隔壁班的男生中田俊也找尋失蹤的哥哥、柯南似乎認為與害他變小的黑衣人有關。

柯南跟著可疑男子來到大渡間車站遍尋未得結果、詢問房屋仲介最近倉庫租借情形、卻發現步美等人也跟來了、幾經察訪、最有可能的就是警察局邊的報社有可能印製偽鈔、步美等人不聽忠告差點招致性命危

柯南再解開黑暗組織來的女子疑惑之後、竟意外發現身邊的新同學小哀原來是吃了黑暗組織的藥物之後讓身體縮小的一個成員、吃驚不己、為了找出這種藥物的磁片、他們來到小哀姊姊過去的教授家、卻發現他陳屍書房、難道是黑暗組織下的手嗎？

柯南在聽過每個到過廣田教授家的人的供詞之後、發現答錄機的錄音帶上都有稍微的間隔、終於找出兇手製造密室的手法、並且以阿笠博士之名揭發了真凶白倉先生。

柯南和步美幾個同學在元旦的時候到國立競技場看天皇杯的足球決賽、未料掉在他們觀眾席下方的足球竟然遭人射擊洩氣了、而且歹徒還威脅要對場內觀眾開槍、在目暮警官的積極部署下、眼看就要抓到歹徒誰知卻面對歹徒殺雞儆猴的威嚇、誰會無辜犧牲呢？

經過多方偵查、調出錄影帶來看、始終無法找到取走現金袋的人與什麼人接過頭、最後柯南終於想到、另一名歹徒就是負責13號機攝影的蛭田、原來他為了一年前計劃搶劫銀行遭日賣電視台策劃的節目破壞、害女友自殺心生恨意、才計劃報復。

園子參加網路上的魔術愛好者聯盟進行網上交友、最後大家決定當面聚聚、便邀小蘭一起上雪山的別墅、毛利與柯南送行、在毛利與柯南回程途中、從收音機聽得、該聯盟的聊天室室長陳屍家中、而且電腦上留有疑似連續殺人的字句、連忙折返時、唯一聯絡的吊橋卻被燒了、柯南趁橋斷前跑了回去、小蘭他們會有危險嗎？其中有何秘密呢？

在濱野先生死後、貴久惠又差點遭到從樹林裡射來的石弓之箭所傷、正當眾人互相推諉之際、柯南卻看出了兇手行兇以及完成不可能犯罪的手法、兇手到底是誰？他的動機為何呢？

原來殺人者就是田中貴久惠、他是已故魔術逃生大師春井風傳的外孫女、為了西山務與濱野利也對外公之死不敬的態度因此設下一整套殺人計劃、未料同是網友的土井塔克樹竟是怪盜基德的化身、對於田中的存在早有懷疑、卻未能阻止悲劇。

步美與一個即將離開原本和母親常去的美容室的美容師相約星期六到她家去剪頭髮、未料和柯南一行人到的時候卻發現該美容師美香陳屍自己家中、雖然已經知道兇手就是店長：五島綠、卻必須找出凶器才能定她的罪。

阿笠博士帶著柯南一行小孩去露營、沒想到卻忘了帶帳篷、誰知回程路上卻迷了路、意外遇到一棟豪華的西式城堡、在主人好意之下願意留他們住一天、但是柯男卻在一個密道內發現了一具骸骨、還被打昏了、他會有危險嗎？

繼柯南離奇失蹤之後、阿笠博士、元太、還有光彥有相繼失蹤、更讓灰原了解到事態嚴重、便親自入失過火的塔內探究、最後真相大白、兇手就是偽裝大太太的西川睦美、為了得到寶藏、不惜整容成一個老婦、得到的確是一片美麗的風景。

杵花７號電影院因為年代久遠、又被房屋仲介業者張田買走、面臨關閉的命運、卻在最後營業的這天發現張田被吊死在放映窗口前、兇手到底是誰？柯南又該如何破解兇手所使用的犯案手法呢？

就在警方要以自殺案件打道回府時、光彥提出了疑點、灰原對於鏡子的感言又讓柯南有了新的啟發、終於找出古橋利用鏡子折射播映影片的殺人手法。

步美生病留在家裡靜養、誰知卻碰上闖空門的強盜犯、步美緊急利用臂章送訊息給柯南、柯南好一會才解開那個訊息的意思、得知她已身陷險境、前去支援、還好與其他夥伴一起打倒了歹徒。

服部平次和女友和葉從大阪來參加母親同學之子的婚禮、順便參觀東京、由毛利帶著小蘭、柯南一行作陪、巧遇森園家的管家重松、便一起來到森園家作客、就在毛利等人要離開時、卻發生了命案、這宗密室殺人案的兇手是誰、目的為何呢？

柯南與服部平次原以為重松的命案是件密室殺人案、未料這只是兇手菊人的一個幌子、為的是要製造疑惑、嫁禍給傭人櫻庭、報復重松破壞他的婚事、還有櫻庭搶走未婚妻之恨、事實證明、一切都是他自己誤會了。

柯南與小蘭、園子一起到療養院的屋頂觀星、誰知卻目擊到就讀東都大學研究所的野中浩一從對面的轉播塔上墜落的一幕、未料這竟是秋本廣志為了報復他一人獨占星象先鋒獎的行動。