名偵探柯南

有個三年前曾經被小五郎逮捕的小偷、出獄之後不但整型還改了戶籍就是為了對小五郎進行報復、讓一切看起來好像是別人把小五郎誤認成一個叫木村的人、所進行的復仇計畫…

毛利小五郎受邀到一個音樂世家設樂家的宅邸、調查圍繞在一把名琴：斯托拉第巴力歐斯身上的種種不可思議詛咒、沒想到當晚就發生了一場火災、燒死了知名指揮家設樂弦三朗…這到底是縱火還是意外呢？

僅繼弦三朗之後、設樂家的老太太絢音也跟著跳樓自殺、設樂家就像被什麼魔咒所詛咒了般、柯南認為這個連續殺人案尚未結束、卻被毛利叔叔譏為無稽之談、接下來還有誰會遇害？兇手何人？目的何在？一切謎團都有待柯南抽絲剝繭的解開…

為調查真相，柯南又重返兩個案發現場，他從鑑識人員那裡得到了小提琴琴橋以及指揮棒的尖端，只要有這兩個東西，老太太自殺的結論就可以被推翻，柯南依舊利用老方法把小五郎麻醉，將四名最有嫌疑的人叫到老太太死時所在的房間，將兩年前以及今天所發生的慘案真相一一

毛利應鹿兒島日賣電視台之邀錄製開台特別節目、因為電視台台長非常滿意、便派手下帶他去喝當地最有名的名酒「高隈」、沒想到卻因此捲進一宗綁架殺人的命案中、兇手到底是誰？他將人殺死後又帶往別處有什麼原因？

柯南在看到鹿兒島上的櫻山後、突然靈光一現、立刻將所有的線索通通連在一起、得到了清楚的解釋、並在大家面前利用沉睡的小五郎這個幌子進行一場完美的推理、順利將兇手糾舉出來…

鳥取縣警局希望總局能夠調派人力支援、目暮警官和松本管理官都決定派遣三課的高木警官前去支援、但偵辦此暗一去可能就是幾年、他和佐藤警官的愛情可能就此無疾而終、他該怎麼辦呢？

柯南從千葉警官家的掛鐘發現了破綻、進而利用引導的方式帶領高木警官和佐藤警官一步步破解兇手加藤的手法與他的心房、總算解開了這一宗因為女友變心導致的命案、最後高木警官也才知道原來要調派鳥取的不是他而是高木長警官…

一家工廠的社長：北村遭人殺害陳屍在辦公室、最有嫌疑 的人是他過去的同窗好友：南田、但是南田身高186、北 村身高166、根據北村身上的刀傷根本不可能是南田所為、意外碰上高木警官詢問此案的柯南該如何解開此案呢？

堂本金屬的社長正三郎在散步途中遭人綁架、但是去取贖金的人在路上車禍身亡、這下根本不知肉票藏在何處、正三郎又有宿疾、必須定時吃藥打針、柯南會如何在緊迫的時間內找出肉票、破解這宗綁架案呢？

柯南們在露營場地附近意外發現一間廢棄的大宅院，那兒看似荒蕪，想不到除了刻有神秘暗號的石燈籠之外更發現一個殺人現場，從有限的線索判斷，這應是一椿尋寶引起的犯罪，然而石燈籠暗示的鑽石以及死者筆記本中的魔術師到底跟這宗殺人事件有什麼的關係呢

柯南根據現有的線索判斷，認為被殺害的玉井先生筆記中提及的小偷應該是怪盜基德，為了解開謎團，柯南決定進入神秘的大宅院一窺究竟，想不到屋子裡除了機關重重之外，還踫到三個寶藏獵人，殺人兇手究竟是基德還是這三人其中一人呢？

第三樣神器終於被找到了，上頭寫的字是龍，炎，永加上龍，搭配上墓碑上的提示，原來鑽石就在最明顯之處，然而讓人意外的是這顆寶石居然是啟動最大機關的鑰匙，原來吉右衛門早就設定不讓任何人拿走這顆寶石，即使是怪盜基德也決定放棄它。

發生在公寓內的自殺案件，但和菓子店老闆娘悅子卻堅持是死者男友兼上司，為阻止女友小澤出面自首而犯下的殺人事件，然而死者男友清水卻有完整的不在場證明，反而使得悅子成了頭號嫌疑犯。

毛利小五郎接到狩谷家伴子太太幫忙找手機的委託，原本以為只是單純的鬧劇一場，想不到卻傳來伴子太太被殺死的消息，狩谷家其它三名成員好像各自過著自己的生活，然而因為伴子太太手機是在家中失而復得，因此又好像跟他們脫不了關係，凶手是否就是這三人其中之一？或者12年前跟12年後的事件又有什麼關連呢？

伴子遺失的手機意外扯出12年前未了解的案件，經過柯南若不經意的引導，終於查出真正的兇手是滋英，然而意外的是原來12年前12年後的事件是有連帶關係的，滋英之所以保護了弟弟原來是為掩飾自己的罪行。就在柯南成功引導毛利破案之時，他的身份也開始遭小蘭嚴重懷疑…

從上次發mail的意外開始，小蘭總覺得柯南和新一的關係絕不簡單，甚至種種跡象顯示，柯南似乎就是新一，小蘭撿到了柯南不小心掉了的手機，正好給她確認的機會，然而一開始她就踫上開機密碼的難關。

正當柯南們隨著高木刑警到珠寶店買禮物時，居然遇到搶案發生，高木刑警試圖得逮捕犯人，想不到犯人居然從大樓頂樓一躍而下身亡，然而搶犯在行搶時的奸笑讓柯南直覺包括搶犯自殺之事都並不單純。

狡猾的貓田社長無疑是珠寶搶匪同時也是殺死後村的兇手，然而要使他認罪還是需要無容辯解的鐵證，柯南從搬家業者口中得知貓田指定要在這樣的下雨天搬家，又得知他曾練過三鐵，更讓柯南確定貓田一定是用了什麼特技進行這宗殺人案。

隔壁班的女生百合子找到少年偵探團，拜託他們解開她從未謀面的曾祖父所留下的謎題，於是大家在一位身份不明自稱是時鐘的男人的帶領下來到了謎題的所在——天使之館…

天使之館的地下室竟是一個巨大的迷宮，所幸少年偵探團發揮智慧順利走出了迷宮，然而當柯南發現即使第二道謎團解開時間仍然不夠時，他便開始懷疑時間先生與這個繼承權尋寶遊戲有緊密的關係。

搞笑藝人廣松晨跑時發現了一具屍體，驚慌失措的他匆忙報警，不料他這個第一發現者卻成了最大的嫌疑犯，因為屍體擺出的剪刀手正好與廣松的藝名一樣，高木警官了解案情之後，認為自己的朋友絕對不會殺人。另一方面，柯南從死者的朋友那裡得知了一些關鍵訊息，於是在他的引導下，一心想要幫朋友洗清冤屈的高木警官推理出了這個讓人心酸的真相…

平次和和葉來到東京與柯南，小蘭一同欣賞魔術大師星河童吾的表演，卻陰錯陽差與包括星河在內的三位魔術大師結識，原來他們都是正影大師弟子，這天正好是正影大師失蹤十週年的日子，所有人一同來到大師家中聚會，這三位看似融洽，但談話中卻也顯示他們三人為誰是正影第一弟子頗有心結，就在此時停電加上小蘭和葉的驚聲尖叫，究竟是發生什麼事了？

南們來到正影大師的家中，卻發生大師其中一名弟子展子小姐被謀殺的意外，然而正影大師自己所設計的房子中構造之特殊，讓平次和柯南都覺得一定跟事件有關，加上正影大師記錄魔術手法的筆記本似乎又是兇手的目標，於是柯南們開始朝曾進出這房子的人查起，就在此時柯南看到三名弟子年輕時合照，難道是那麼一回事嗎…

發生在正影大師家中的殺人案，死者展子遺體出現的十分奇特，加上正影太太無意間透露在同一位置的聖誕樹魔術，讓柯南和平次感覺這兩者一定有所關聯，果然這是一椿結合魔術技巧的殺人事件。

伊東玉之助的劇團又來柯南們住的地方舉行公演了，淒美的竹取物語故事，想不到真的發生，原來飾演輝夜姬的蓮華被綁架了，然而原本只是為反抗父親而安排的自導自演竟然變成真的綁架案，如同竹取物語中五名向輝夜姬求婚的貴公子一樣五名向蓮華父親表達希望將蓮華嫁給他們的商界達人，是否跟這宗假戲成真的綁架案有關呢？

表演就要開始了，為了不讓全場觀眾失望，小蘭決定粉墨登場，同時玉之助和柯南加上少年偵探團在有限的時間內努力尋找蓮華，就在此時片岡的秘書也帶著贖金出發，然而他可疑的行徑引起了柯南的懷疑...

柯南一行人來到山上採集昆蟲，雖然找不到甲蟲，但阿笠博士卻出了一道謎題要柯南們找到寶藏，然而這謎題的暗號卻是連柯南都摸不著頭腦。

步美在無意中提到溫泉標誌倒過來看起來像水母的事，終於讓柯南解開了阿笠博士與灰原設計的暗號，然而就在同時，他也驚覺園子所看到的文字所隱藏的事實，原來那就是兇手的名字。

著名的偵探節目製作人邀請三位編劇一同來分享毛利小五郎的實際經驗，想不到卻發生其中一人被毒殺的事件，其中新人編劇香田的嫌疑最大，但在他不在場的情況下，含有毒藥的咖啡是如何隨機被送到被殺的八神手中是個難解的謎。

步美的好朋友由香心愛的鸚鵡居然死了，少年偵探團的光彥，元太還有步美決定自己找出這個事件背後的真相，他們堅決懷疑由香媽媽的朋友阪口先生拿研究室的毒藥企圖殺死由香和她的媽媽，想不到這個事件的真相，其實是隱藏著感動人的美意…

柯南隨著毛利小五郎來到一座豪宅，看似華麗的外表，裡頭卻藏著恐怖的靈異事件，豪宅的主人國友淳大自從作惡夢之後接連發生意外，淳大和他太太認為這是惡靈的詛咒，然而隨著他們友人的死亡，看似靈異的事件卻牽扯出十三年前的海難意外，這一連全都發生在佛滅日的事情，究竟和國友府的過去有何關係…

隨著關口先生自殺疑雲發生之後，在他身上找到的卡片牽扯出十三年前發生的船難意外，而宅第裡也有四位是當時船難死者的遺族，雖然他們各自繼承著死者的工作，但與事件的關係使他們也成了事件的嫌疑犯。

當小蘭提及情侶裝一模一樣的裝扮，再加上茂子太太曾提及每年三家人舉行的生日派對次數，柯南赫然發現這宗殺人事件的真相。

一棟可愛的洋房住進了一對老夫婦，除了姓氏奇特之外，柯南對他們為何要住在這麼不宜老人的屋子裡感到疑惑，同時，柯南一直覺得好像有人在監視他，當他發現那棟洋房閣樓天窗的相機鏡頭時，想到會不會是黑色組織的人想對他怎麼樣，當他和灰原潛入那棟洋房裡，發現許許多多柯南的照片以及疑似變裝的痕跡，柯南突然想到有可能是誰…

柯南們到出雲旅遊，意外碰上一宗彷彿八岐大蛇神話情節般的殺人事件，被殺的是一個心腸惡毒的企業家，經過條件篩選之後，與他曾有過節有可能下手的嫌疑犯有四名，其中包括柯南等人在旅途中結識的老牌旅館千金江角榮子以及她的青梅竹馬福間良介。在偵訊的過程中，柯南發現他們兩人似乎都想保護對方，然而犯人似乎也並不是他們，於是柯南下定決心要替他們證明清白。

證明了榮子的清白，雖然福間確實拿走了刀，但他果然也不是殺人凶手，他們兩個原來都是誤以為對方是兇手才會說謊的。

一封字跡有些模糊的明信片，居然是阿笠博士初戀情人最後的留言，留言當中十年一會的約定，卻因為博士始終沒有想起信中所指定的地點是哪裡而一再錯過，在步美們的起哄下，柯南們開始根據上頭的線索尋找可能的地點。

一聽到博士說初戀女孩的父母其中之一是外國人，柯南頓時完全明白了明信片上數字提示的意義，那些數字各自提示了四個她與博士充滿回憶的地點，然而真正約定見面的地方，竟是大家都那麼熟悉的地方，卻也是讓那女孩得到心靈支持最有意義的地點…

步美無意間在松浦先生家的橄欖樹上發現了毛毛蟲，而且是一天增加一隻，總共四隻的毛毛蟲，然而這幾隻毛毛蟲卻意外讓善良的圭一扯上殺人事件，原來這些毛毛蟲是他為了保護過逝媽媽心愛的橄欖小樹一天一隻移過去的，然而卻在最後一天撞見了殺人兇手，他在偷移毛毛蟲和檢舉犯人的矛盾中掙扎，然而這時殺人兇手卻已經逼近他的身後準備殺人滅口。

一群朋友正要開派對，卻發現派對主辦人死在屋裡，驗屍官推斷死亡時間是在下午四點半到五點之間，死者的朋友似乎都與此案件無關，然而柯南卻從未煮透的濃湯加上死者新安裝的瓦斯爐地震感應器察覺到死亡時間應該不是如表面顯示的那樣…