假面騎士Gotchard

原本只是普通高中生的一之瀨寶太郎，跟他的同班同學九堂凜音產生了一些爭執。原本想上前理論的寶太郎，卻意外地發現了九堂擁有神祕的力量，而且還碰見了一隻奇怪的蝗蟲。就在他不知道如何是好的時候，一輛蒸汽火車突然衝了過來，並把他帶到了另一個世界。就在那裡，他遇到了一個神祕男人，他從男人手上拿到了驅動器，並被託付了拯救世界的使命。隨後，男人為了阻擋冥黑三姊妹而犧牲，寶太郎雖然回到了現實世界，但由於101隻克米被釋放出來的緣故，街上開始動盪不安。此時冥黑三姊妹追擊而來，為了保護大家，寶太郎啟動了驅動器……。

一頭霧水的寶太郎，為了了解更多有關克米的事，跟著阿湊老師來到了鍊金學院接受測驗。在測驗上，凜音向寶太郎詢問驅動器的來歷，在得知是從自己父親手上拿到的之後，留下寶太郎一個人就轉身離開了。隔天，對鍊金術一竅不通的寶太郎，正在煩惱要怎麼讓兩隻不同重量的克米轉變成相同重量。此時凜音再次出現，對寶太郎解釋了一些鍊金術的基本概念，途中滑板瑪魯加姆突然出現了。為了拯救彎曲滑板，寶太郎再次變身成為假面騎士，這次還用上了新的組合……。

夢想跟所有克米成為夥伴的寶太郎，為了成為厲害的鍊金術師，想要請阿湊老師給他一隻最難相處的克米。就在他還在想辦法跟那隻克米──壯烈武士道打好關係的時候，瑪魯加姆出現了。寶太郎雖然想阻止他，但壯烈武士道卻不願意配合，也因此害得寶太郎中了麻痺毒，沒能拯救大家。幸好阿湊老師趕來拯救了他，但沒能拯救大家的愧疚感，讓他重新思考了自己對克米的態度。就在這時，那個盯上寶太郎的神祕男子突然出現，並叫他交出驅動器……。

突然出現的神祕男子叫做史帕納，原來他是鍊金學院的高層派來幫忙回收克米的人。不過寶太郎注意到，他似乎特別在意凜音，也對凜音特別好。就在寶太郎疑惑史帕納是否喜歡凜音的時候，克米昇華器感應到克米出現了。寶太郎跟凜音追過去一看，才發現自己中了冥黑三姊妹的陷阱。她們是為了驅動器，才故意用克米來做誘餌。這次留下來應戰的是冥黑三姊妹的三女──拉克西斯。在跟她對戰的途中，她告訴了寶太郎他們，交付驅動器的人正是凜音的父親，九堂風雅，而且他已經被殺害了。得知這個消息的凜音久久不能釋懷，開始跟寶太郎講起她跟她父親的事……。

聽到蓮華與錆丸抓到大量克米的寶太郎，決定向他們請教抓克米的訣竅，於是他們跟隨蓮華的直覺來到了職業摔角道場。此時他們遇到了這裡的館長與來討土地的流氓。經過館長的解釋，才發現館長除了被炒地皮商人暴力強搶土地外，還因為一位名叫剛力的前摔角手鬧場，導致沒人敢進入他們道場學習。但即使如此，館長還是沒有放棄想要教育下一代的夢想，這個夢想吸引了同為摔角手的克米──摔角手G，決定陪伴他守護道場。聽到這件事的寶太郎決定要跟館長學習摔角，並從被變成瑪魯加姆的剛力手中守護道場……。

史帕納突然來到了寶太郎家的店，還點了早餐來吃。寶太郎雖然滿臉疑惑，但還是做了早餐給史帕納，然而史帕納卻說難吃，還打算要借廚房露一手。當他的料理獲得媽媽跟加治木的賞識後，心中感到不平的寶太郎決定追上史帕納好好跟他理論一番。然而，他卻發現了另一位在尾隨史帕納的奇怪男人。後來才知道，原來他是在超A級鍊金術師的最終測驗中敗給史帕納的一名鍊金術師。為了奪回他應有的榮耀，他一直在背地裡偷襲史帕納，甚至還因此變成了瑪魯加姆綁架了凜音。但他不知道的是，史帕納根本不知道他是誰……。

正在爭論新的克米是誰抓到的寶太郎一行人，在討論的途中突然跑來了一個小孩。原來是他看見了寶太郎他們剛才抓機械螃蟹的過程，所以決定把他身邊的另一隻克米──尖針仙人掌交給他們。寶太郎好奇他為什麼要跟克米分開，但他卻說只是因為爸爸叫他丟所以他就丟了。認為他內心其實渴望跟克米在一起的寶太郎不顧眾人阻攔，決定違反克米的戒律，試圖解開小孩的心結並幫助他接納自己真正的想法。就在他跟那位小孩談論的過程中，一位神祕的男人虎視眈眈地盯著他們並轉變成瑪魯加姆，向他們發動了攻擊……。

在與瑪魯加姆戰鬥的過程中，尖針仙人掌逃跑了。擔心尖針仙人掌的理玖終於願意訴說他與尖針仙人掌──仙之助的故事。從小一直專心唸書的他，非常想要朋友。就在這時，他遇到了仙之助，並跟他成為了好朋友。但同時，他的成績也開始變得不穩定，還上課還常常遲到。結果發現這件事的爸爸，氣得叫他把仙之助丟掉。沒能完成跟爸爸的約定，也沒能保護好仙之助的理玖非常自責。寶太郎跟他約定，一定會找到仙之助，於是他叫出了智慧型手機幫忙尋找。在找到仙之助之後，雖然理玖他們暫時解開了心結，但變成瑪魯加姆的爸爸卻依然想要把害他兒子不能用功唸書的因素全部清除掉……。

聽說有人在京都看到了幽浮，於是寶太郎他們一行人，決定趁這次校外教學找到傳說中的幽浮！但在途中，蝗蟲1號卻偷偷藏在寶太郎的背包裡，而且還被加治木看到了！就在加治木追著蝗蟲1號不放的時候，彷彿命中注定一般，他遇到了跟他一樣在《超常行星》上投稿過的女性──姬野聖。雖然加治木很想跟她繼續聊《超常行星》的話題，但很可惜她要上班先走了。於是，加治木他們決定把這次校外教學的目標從幽浮改成尋找姬野聖，並開始在太秦映畫村到處找人。雖然最後他們找到了她，但與此同時阿湊老師收到了消息，發現冥黑三姊妹的克洛托也來到京都了……。

在擊敗了矢吹變成的瑪魯加姆之後，阿湊老師發現被克洛托放走的人還有一個，那個人就是姬野聖的哥哥──姬野劍。為了拯救克米與聖，寶太郎跟阿湊老師急忙趕去現場，而凜音等人則留下來照顧失戀的加治木。然而聽到新聞的加治木，知道劍是聖的哥哥後，擔心聖的安危，也跟著跑去了現場。就在寶太郎他們變身成消防薔薇解決掉劍變成的瑪魯加姆後，聖卻開始轉變成瑪魯加姆了。一直相信著哥哥的聖，被哥哥背叛以後內心開始崩潰，她的惡意吸引了雷電池。不想強制分離克米的寶太郎，被聖打得無法還手，這時加治木站了出來……。

結束校外教學的寶太郎一行人，重新開始捕捉逃走的克米。就在他們以為這樣的日子會持續下去的時候，鍊金聯盟卻為了調查間諜以及假面騎士的事來到了鍊金學院。正當他們因為調查官逼迫寶太郎交出驅動器，所以跟調查官抗爭的時候，警報聲突然響起。原來是冥黑三姊妹闖入了學校，為了保護一般學生，寶太郎他們開始尋找她們的身影。這時，阿特羅波斯又再度找上了凜音……。

雖然發現了間諜是誰，但間諜達成使命後，阿特羅波斯便把她處理掉了。就在寶太郎不解她們為什麼要殺掉汐里的時候，冥黑三姊妹出手綁架了錆丸，並強迫他使用了Dread驅動器跟大家戰鬥。被迫與同伴戰鬥的寶太郎沒辦法發揮全力，只能任由他傷害自己。最後寶太郎解除了變身，被黑色的假面騎士壓在地上打。幸好蓮華喚回了錆丸的意識，成功阻止他繼續毆打寶太郎，但卻沒辦法阻止他繼續被冥黑三姊妹控制。就在大家陷入絕望時，幽浮X出現了……。