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25分
第3集【漆黑的神秘列車(發車)】 少年偵探團獲得了蒸汽火車『鈴木號特快車』的搭乘用戒指，本來想要來一場開心的火車之旅，但火車之中早已危機重重，黑衣組織已接獲情報得知原本名為雪莉的灰原將會坐上這台列車，他們將佈下天羅地網，對付灰原…
25分
第4集【漆黑的神秘列車(隧道)】 少年偵探團搭上鈴木號特快車，並參加了列車內舉辦的推理遊戲。柯南發現8號車廂的乘客們神情非常詭異，而原本單純的推理遊戲，隨著一道槍響，急轉直下成了一起密室殺人事件。就在柯南一行人為這場殺人案進行推理時，一道暗影悄悄靠近了灰原…
25分
第5集【漆黑的神秘列車(交叉)】 一起發生在鈴木號特快車的殺人命案，柯南、世良、小五郎正絞盡腦汁地進行推理。嫌疑犯的共通點都始於一場五年前的火災，一位背著竹劍、臉上有火災燒傷的能登泰登、在火災中被救出來的安東諭、因為火災而只能靠輪椅代步的小蓑夏江，以及她的女僕住友日花。犯人就在這些人之中…
25分
第6集【漆黑的神秘列車(鐘點)】 少年偵探團和毛利小五郎一行人一同搭上鈴木號特快車，車廂內卻發生了一起密室殺人事件，就在柯南終於解開謎題後，不僅黑衣組織一步步逼近灰原，甚至有一位臉上有燒傷痕跡的男子綁架了世良！？而波本的真面目又到底是誰！？
25分
鈴木次郎吉顧問為了怪盜基德不但睡不著，連飯都吃不下，這次他決定用寶石涼鞋紫色指甲來引誘怪盜基德自投羅網，為了不讓怪盜基德有脫逃的機會，次郎吉決定在銀宿大街中央展示寶物並且包租下路口的四棟大樓，設下天羅地網非逮到怪盜基德不可…
25分
怪盜基德用他所謂的瞬間移動的方式，成功地擺脫層層包圍得到寶石涼鞋，不過其中一隻鞋是次郎吉故意安排的贗品，於是怪盜基德再次預告明晚將再來一次，請次郎吉準備好另一隻真品寶石鞋，這一次柯南是否能看穿他的瞬間移動的魔術手法呢？
25分
柯南們在露營場地附近意外發現一間廢棄的大宅院，那兒看似荒蕪，想不到除了刻有神秘暗號的石燈籠之外更發現一個殺人現場，從有限的線索判斷，這應是一椿尋寶引起的犯罪，然而石燈籠暗示的鑽石以及死者筆記本中的魔術師到底跟這宗殺人事件有什麼的關係呢
25分
柯南根據現有的線索判斷，認為被殺害的玉井先生筆記中提及的小偷應該是怪盜基德，為了解開謎團，柯南決定進入神秘的大宅院一窺究竟，想不到屋子裡除了機關重重之外，還踫到三個寶藏獵人，殺人兇手究竟是基德還是這三人其中一人呢？
25分
第三樣神器終於被找到了，上頭寫的字是龍，炎，永加上龍，搭配上墓碑上的提示，原來鑽石就在最明顯之處，然而讓人意外的是這顆寶石居然是啟動最大機關的鑰匙，原來吉右衛門早就設定不讓任何人拿走這顆寶石，即使是怪盜基德也決定放棄它。
25分
園子的伯父鈴木次郎吉，又一次對基德發起挑戰。這次的賭注，是世界最大的海螺珍珠——「妖精之唇」。不僅一如往常出動警視廳的警力，這次還有來自長野縣的得力軍師——「諸伏高明」。另一方面，受到工藤新一刺激的服部平次，也想奪走少女的唇。
24分
【跨越時空的櫻花之戀】 煙火大會的晚上小林老師遇上了一樁殺人案,被害者是當舖的女老闆隅田晶女士,我們從與她有恩怨的人之中過濾出三個沒有不在場證明的嫌疑人,但是請有聽到兇手和被害者爭吵聲的小林老師聽過這三人的錄音之後,卻找不到和當晚的兇手的聲音相符的人…
25分
一場圍繞著世界最大的海螺珍珠「妖精之唇」，所展開的攻防戰。面對高明佈下精妙防線，基德為了奪走妖精之唇，將目光轉向了高中生偵探。然而，在這顆妖精之唇的背後，似乎還隱藏著一段不為人知的故事。
24分
【消失在黑暗中的麒麟角】 怪盜基德發出了一封預告信,要來盜大寶石麒麟角,這個麒麟角被安置在三水吉右衛門的機關裡只有對四個台座插進四把鑰匙,並且同時轉動才拿得出來,這次由無法喬裝成我們小孩的少年偵探團負責看守這四個台座,但是在黑暗中柯南被弄昏,麒麟角也瞬間失去了蹤影…
24分
【基德VS,四神偵探團】 由於柯南昏了過去,只好由少年偵探團負責推理首先,灰原看到當初設計這四個台座機關的三水吉右衛門刻在保管麒麟角的立柱上刻的字,她領悟到這段話的意思,像是不用鑰匙也能打開立柱這也成了破案的關鍵,不過真正揪出怪盜基德真面目的還是早已甦醒過來的柯南…
25分
第19集【怪盜基德與赤面人魚(前篇)】 怪盜基德再度現身！這次他的目標是鈴木次郎吉舉辦的寶石展示會中展覽的紅寶石赤面人魚。看著放在水族箱中的赤面人魚跟悠哉的烏龜一起移動，深信這次決不會讓基德得逞的警官們，卻驚覺寶石在一瞬間就連同烏龜一起消失了！？
25分
第20集【怪盜基德與赤面人魚(後篇)】 原本應該要延後展示的紅寶石赤面人魚，在鈴木次郎吉的要求之下，毅然決定公開展示，主辦方和警方佈下重重機關，做好完全準備防止基德下手行竊，卻仍然在基德預告的犯案時間內，眼睜睜讓烏龜和背上的寶石消失在眼前。基德究竟是怎麼偷走寶石？他是否又喬裝成某個人混在柯南的身邊呢？
25分
在鈴木次郎吉宅邸中的大金庫鐵狸，是由幕末的機關師三水吉右衛門打造出來，號稱是誰都無法攻陷的最強金庫，怪盜基德卻針對這個鐵狸送來了挑戰書，宣稱自己將來打開曾經擊退過無數盜賊的這個堅固之門…
25分
第33集【怪盜基德對京極真(前篇)】 怪盜基德又送出了預告信，這次的目標是園子的叔叔 - 鈴木集團的顧問準備要公開展示的珍貴寶石「翠綠皇帝」。園子知道之後反而顯得很開心，這件事情讓京極真打翻了醋罈子，毛遂自薦的要擔任寶石的護衛。
25分
怪盜基德預告作案的當天，雖然中森警官率領警隊佈下了嚴密的防衛網，但是像是在嘲笑他們般在裝了重量感應器的金庫室裡，又出現了基德的第二封預告信，他到底是怎樣避開重量感應器的呢？他又如何打開這個金庫的門呢？
25分
第34集【怪盜基德對京極真(後篇)】 京極真開始保護寶石之後，一直收到署名要寄給京極真的信件，而且都是些莫名奇妙或是無關緊要的內容，反而讓柯南覺得其中必有詐。終於在抽絲剝繭之後，識破了怪盜基德是和園子聯手要偷走寶石，園子的目的究竟是什麼呢？
25分
第51集【柯南與基德的龍馬寶物攻防戰(上集)】 怪盜基德又送來了預告信，但是這一次他聲稱要將以前被別人偷走的寶物送還給它們原來的主人，而這三件物品都和阪本龍馬有所關聯，正好這些寶物的原主樽見先生和鑑定家華村先生 正一起在鈴木大博物館舉辦龍馬展…
25分
第52集【柯南與基德的龍馬寶物攻防戰(下集)】 會場正在展出高杉晉作隨同槍一起送給龍馬的 鑲有紅寶石的珍貴槍帶，因此基德是為了盜取槍帶而來的傳聞也流傳開來，由於基德要拿來歸還的物品當中包含一把手槍，因此會場內事先設置金屬探測門，但是隨著人潮增加卻沒有發現任何的可疑人物…
25分
園子參加網路上的魔術愛好者聯盟進行網上交友、最後大家決定當面聚聚、便邀小蘭一起上雪山的別墅、毛利與柯南送行、在毛利與柯南回程途中、從收音機聽得、該聯盟的聊天室室長陳屍家中、而且電腦上留有疑似連續殺人的字句、連忙折返時、唯一聯絡的吊橋卻被燒了、柯南趁橋斷前跑了回去、小蘭他們會有危險嗎？其中有何秘密呢？
25分
在濱野先生死後、貴久惠又差點遭到從樹林裡射來的石弓之箭所傷、正當眾人互相推諉之際、柯南卻看出了兇手行兇以及完成不可能犯罪的手法、兇手到底是誰？他的動機為何呢？
25分
原來殺人者就是田中貴久惠、他是已故魔術逃生大師春井風傳的外孫女、為了西山務與濱野利也對外公之死不敬的態度因此設下一整套殺人計劃、未料同是網友的土井塔克樹竟是怪盜基德的化身、對於田中的存在早有懷疑、卻未能阻止悲劇。
25分
怪盜基德名振天下、偷遍世界珍寶、目前將焦點放在日本、並寄出通知函預言要盜取鈴木集團傳家之寶：暗夜星辰、鈴木園子為目賭基德廬山真面目、不欲求助警方、遂央請好友小蘭的父親偵辦此案、柯南該如何破解基德這位千面怪盜的計劃呢？
27分
基德在嚴密警力防守與鈴木夫人的製造仿冒品之後仍然將真品的黑珍珠盜走、最後終被柯南找出破綻、發現他已化身成小蘭藉著扶鈴木夫人之便偷了珍珠、但最後卻為了救被放在救生艇上的小蘭而放棄追怪盜的機會。
25分
柯南隨著毛利小五郎來到了一位畫家的毫宅，原來他收到怪盜基德的預告函表示要搶走他最新的作品，然而就在基德預告的時間前屋裡突然停電，接著便發生了畫消失以及年輕畫家的岳父老畫家在同一個工作室裡被殺死的事件，柯南始終不認為這是基德的作為，因為怪盜基德從不殺人，直到年輕畫家企圖引導辦案方向的行徑出現，柯南開始懷疑這一切都是他安排的…
25分
及川工作室裡發生的命案，包括消失了的新畫，一切看起來都像是基德所為，然而就在高木用一個小魔術表示了他對這個事件的想法時，柯南終於明白這一切是怎麼一回事，包括所謂消失的名畫根本就沒有存在過的事實，以及怪盜基德雖然不是這個事件的主角但原來就在大家之中的秘密…
25分
圖書室裝著小紙條的皮包,讓柯南想起了十年前的往事，原來十年前新一和小蘭曾在學校的圖書室遇到一個"鬼"，他雖然沒有想要直接傷害新一和小蘭，卻在自稱是新一弟弟的情況下向新一提出挑戰，他交給新一一個暗號，並承諾如果新一成功解開謎題就讓新一知道他的真面目，於是在一張又一張的暗號下，新一和小蘭展開了冒險…
25分
新一們一路隨著暗號終於來到了最後一站，最後紅色的東西竟然是天邊一大片夕陽，柯南原以為這一切都是爸爸為讓他走出戶外的精心安排，但在十年後重新回顧這次冒險時，柯南才赫然發現當年的結論是錯的，他重新分析最後的暗號，結果從這個舊錢包中找到的竟然是怪盜給工藤優作，也就是柯南爸爸的信，原來這一切都是第一代怪盜基德與柯南爸爸之間的遊戲…
25分
第942集【怪盜基德的機關盒(前篇)】 友寄公華將過世丈夫的大量藏書捐給鈴木次郎吉，以此作為代價，希望他幫忙想辦法打開過世丈夫留下的、幕末知名機關師三水吉右衛門製作的機關盒。據說寫著開盒方法的紙條夾在她丈夫的藏書之中，然而怎麼搜尋藏書仍找不到半點頭緒。由於盒中藏有全世界現存最大顆的月長石「月之記憶」，鈴木次郎吉除了委託小五郎、阿笠博士等人前來幫忙之外，還以寶石為誘餌，向怪盜基德下了戰帖⋯⋯。
25分
第943集【怪盜基德的機關盒(後篇)】 柯南早已察覺基德已經變裝混入一行人之中，卻不知道到底是變裝成誰，眾人分頭尋找夾有開盒方法的紙條卻一無斬獲，雖然鈴木安排開放一般人參觀，任誰都可以挑戰打開機關盒，但也遲遲沒有進展。此時，公華說也許會成為尋找紙條的提示，開始說起她與丈夫學生時期的回憶⋯⋯