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來到深界六層,向「不歸之都」前進…
在已被徹底探索殆盡的世界裡,名為「深淵」的大洞是碩果僅存的秘境。這個深不見底、不知會延伸到何處的巨大垂直洞穴中,不僅棲息著各種稀奇古怪的生物,還沉睡著現今人類所做不出來的珍貴遺物。「深淵」那處處充滿不可思議的神秘樣貌,吸引人們前仆後繼地前去冒險。漸漸地,大家開始將那些多次挑戰大洞的冒險者們稱為「探窟家」。
孤兒莉可住在興建於深淵四周的城鎮「奧斯」,她夢想著將來要成為像她母親一樣偉大的探窟家,並一解深淵之謎。某天,她母親萊薩的白笛被人發現,讓莉可因此下定決心要潛入深淵的深處。她撿到的失憶機器人雷格,也為了尋找自己的記憶而決定與她同行。莉可在深界四層被穿珠的毒給侵蝕折磨,拯救她的是名叫奈奈祈的慘劇終末。奈奈祈加入之後,三個人便繼續前往彭多爾多所在的深界五層冒險。在那裡,他們遇見了一個自稱普魯修卡的女孩。由彭多爾多撫養長大的她對外界一無所知。普魯修卡深深著迷於莉可的冒險故事,並希望能和莉可一起冒險,然而她卻慘遭彭多爾多利用來做實驗。不過後來普魯修卡改變形體,變成莉可的白笛,與她一同朝深界六層「不歸之都」前進。在那裡有座「慘劇終末的村子」,那是擁有自己一套價值觀的慘劇終末們所生活的地方。